Joonas Berghällin Punkkisota-dokumentti alkaa pysäyttävästi kohtauksella, jossa Berghäll itse makaa saksalaisen klinikan vuoteella ja valmistautuu vaaralliseen operaatioon. Vielä ennen nukutusta hän lähettää terveiset kummipojalleen ja ilmoittaa jättävänsä kaiken yhtiökumppanilleen, jos jokin menee pieleen.
Kronologisesti elokuvan keskivaiheille ajoittuvan kohtauksen jälkeen pohjustetaan, miten tilanteeseen on päädytty.
Todettuaan terveydentilansa heikentyneen Berghäll oli kiertänyt lääkäriltä toiselle listaamiensa yli 20 erilaisen oireen kanssa, mutta kukaan ei ollut auttanut. Lopulta yksi lääkäri osasi kertoa, mistä oli kysymys.
Berghäll sairasti kroonista borrelioosia ja kärsi lukuisista muista punkin välityksellä tarttuvista liitännäisinfektioista. Yleensä punkin puremaksi joutunut saa vain jonkin niistä, mutta Berghällillä vaikutti olevan ne kaikki.
Koska Berghäll ei edelleenkään saanut apua Suomesta, hän otti pankista lainaa ja lähti Saksaan hoitoon.
Dokumentaristin mukaan maailmassa on sata miljoonaa borrelioosipotilasta, jotka eivät saa tarvitsemaansa apua. Tautia ei tunnisteta, koska taudinkuvat vaihtelevat ja vasta-ainetestit ovat epäluotettavia.