VR vaihtaa nykyisen punaisen värinsä vihreään vaiheittain keväästä 2009 alkaen. Uudistus näkyy ensimmäisenä konsernin verkkosivuilla, mainoksissa, julkaisuissa ja asemilla. Vihreän ilmeen tavoitteena on korostaa ympäristöystävällisyyttä junaliikenteen vahvuutena.
Vr.fi-sivusto saa uuden vihreän ulkoasun toukokuussa. Samalla sivuston rakennetta on muokattu asiakaspalautteen perusteella. Esimerkiksi Matkahaku aikatauluineen, lippujen osto, liikenteen poikkeustiedotteet ja asiakaspalvelun yhteystiedot löytyvät suoraan etusivulta. Sivuston leveys on sopeutettu nykyaikaisten tietokoneiden näyttöihin, mikä mahdollistaa uudenlaiset palvelut asiakkaille, kuten Päivän säätieto -palvelun. Vr.fi-sivustolla on kuukausittain noin 850 000 kävijää.
Uudistuneilla vr.fi-sivuilla on tietoa VR:n ympäristölupausten toteutumisesta ja entistä laajempi päästölaskuri. Päästölaskurissa asiakas voi vertailla eri kulkumuotojen energiankulutusta ja hiilidioksidipäästöjä 58 yhteysvälillä Suomessa. Sivuston kautta voi myös lähettää asiantuntijoille kysymyksiä ympäristöasioista.