Kalakukko on rekisteröity EU:n Aito perinteinen tuote (APT) -rekisteriin. Kalakukon lisäksi APT-suojauksen saaneita tuotteita on koko Euroopassa tähän mennessä vain vähän toistakymmentä. Näihin kuuluvat suomalainen Sahti, belgialaisia hedelmäoluet Kriek, Gueuze ja Faro sekä Mozzarella -juusto ja Traditional Farmfresh Turkey -kalkkuna.
Aito perinteinen tuote (APT) -suojauksessa suojataan tuotteen nimi ja valmistusmenetelmä. Esimerkiksi Kalakukkoa saa valmistaa missä tahansa EU-maassa, mutta sen on tapahduttava nyt rekisteröidyn perinteisen menetelmän mukaan, jotta tuotetta voidaan kutsua kalakukoksi.
Suomella on vireillä myös APT-suojaushakemus Karjalanpiirakalle, jonka rekisteröinti tapahtunee vuoden 2003 alussa. Aito perinteinen tuote -suojauksen Kalakukolle haki Suomen Kalaruoan Ystävät ry. (Finfood)
