Yritys saattaa pulittaa verkkolaskupalveluista jopa kymmenkertaisen hinnan siitä riippuen, kenen tarjoamia palveluja käyttää. Tämä ilmenee Suomen Yrittäjien selvityksestä, jonka mukaan myös palvelujen sisällöissä on huomattavia eroja. Osa verkkolaskupalvelun tarjoajista perii käyttöönotto-, kuukausi- ja laskukohtaisia maksuja, osa vain yhtä näistä.
Selvityksessä oli mukana kahdeksan verkkolaskuoperaattoria ja kahdeksan pankkia. Kulut laskettiin kahdelle esimerkkiyritykselle, joista toinen lähetti kuukausittain noin 10 000, toinen alle 100 verkkolaskua.
Paljon laskuja lähettävän yrityksen kuukausikulut vaihtelivat 505 -5 676 euron haarukassa, alle 100 laskua lähettävän 21 -356 euron välillä. Edullisin palveluntarjoaja oli SY:n selvityksen mukaan verkko-operaattori Maventa. Hinnat vaihtelivat rajusti varsinkin eri operaattorien välillä, mutta myös pankkien hinnoittelussa oli tuntuvia eroja.