Yli 30 tshetsheeniä sai surmansa kun Venäjän armeijan erikoisjoukot rynnäköivät moskovalaisteatteriin varhain tänä aamuna. Panttivankiuhrien määrästä annetaan koko ajan hyvin ristariitaisia tietoja: aluksi puhuttiin noin 10 uhrista, mutta kello 9 arvio oli jo noin 30. Tshetsheenit olivat pitäneet panttivankeinaan satoja ihmisiä kolmen päivän ajan.
Viranomaiset eivät pystyneet varhain aamulla vahvistamaan siviiliuhrien määrää.
Erikoisjoukot hyökkäsivät teatteriin sen jälkeen, kun kaapparien antama määräaika oli kulunut umpeen ja rakennuksesta alkoi kuulua laukauksia. Joukot käyttivät hyökkäyksessä kaasua ja tunkeutuivat teatteriin seinään räjäytetystä reiästä. Tulitaistelu kesti vajaan tunnin.
Venäjän sisäministeriön mukaan osa tshetsheeneistä pääsi hyökkäyksessä pakoon ja piileskelee mahdollisesti teatterirakennuksessa tai sen huoltotiloissa. Varasisäministeri Vasili Vasilijev kehotti piileskelijöitä varhain lauantaina antautumaan ja lupasi, että heidän henkensä säästetään, mikäli he antautuvat.
Venäläisjoukot eivät kärsineet hyökkäyksessä tappioita.