Tornionjoella pelätään lohestuksen puolesta Tornionjoen kalastajat pelkäävät menettävänsä lohenpyynnin itsemääräämisoikeuden Tornionjoen Naturaan liittämisen myötä. Tornionjoen kalastusalueen puheenjohtaja Pekka Pelttari epäilee, että ministeriryhmän Natura-päätökseen esittämä kalastusta koskeva lisäys voi jättää lohestusoikeuteen tulkinnanvaraisuuksia. "Ministerit tulevat ja menevät, mutta sopimus jää. Natura-päätökseen liitettävään lisäykseen olisi nyt tarkoin kirjattava kuka lohta saa kalastaa ja millä tavoin", Pelttari sanoo.
Erityisesti Tornionjoella pelätään perinteisten kalastustapojen, lippoamisen ja verkkokalastuksen puolesta. Ongelmia synnyttää myös se, että rajajoella kalastavat sekä suomalaiset että ruotsalaiset. "Suomella on nyt valtiosopimus lohenpyynnin kansallisesta päätösvallasta ja Ruotsilla ei. Kun joki liitetään Naturaan, on vaarana että joen vastakkaisilla rannoille tulee erilaisia kalastussäännöksiä", Pelttari epäilee. Hän päivittelee muutenkin vauhtia, jolla Natura-esitys on Ruotsin puolella lyöty läpi ilman alueen ihmisten kuulemista tai yleistä keskustelua.