Suomen Natura-verkoston valmistelu oli kireän aikataulun ja työvoiman vähyyden vuoksi liian suuri ja vaativa tehtävä luonnonsuojeluhallinnolle. Näin toteaa suojelualueverkoston valmistelua arvioinut Valtiontalouden tarkastusvirasto.
Ympäristöministeriö ryhtyi hakemaan EU:n suojelualueverkostoon sopivia alueita viime vuosikymmenen puolivälissä. EU pyrkii verkostolla säilyttämään uhattuna olevia lajeja ja luontotyyppejä.
Naturan valmisteluun liittyvät ristiriidat kärjistyivät vuoden 1997 kuluessa. Viraston mielestä yhtenä syynä tähän oli luonnonsuojeluhallinnon epämääräinen ja liian myöhään aloitettu tiedotus. Maanomistajat kokivat Naturan uhkaavana asiana.
Tarkastusviraston mielestä maanomistajiin olisi pitänyt ottaa henkilökohtaisesti yhteyttä jo valmistelun alkuvaiheessa.
- Jälkikäteen arvioiden luonnonsuojeluhallinto säästi viestinnän kustannuksia väärässä paikassa, sillä Naturasta tuli siihen liittyneiden ristiriitojen vuoksi paljon pidempi, kuluttavampi ja kalliimpi prosessi kuin aluksi arvioitiin, virasto toteaa tutkimuksensa päätteeksi.