Suomenlinna II -lautan pohjakosketuksien ja muiden kolhujen taustalla on tutkintaraportin mukaan muun muassa se, että laivan tilannut varustamo oli tottumaton uudisrakennushankkeisiin.
Onnettomuustutkintakeskuksen mukaan myöskään toimittajana olleella tanskalaisella kauppahuoneella ja laivan rakentaneella puolalaisella telakalla ei ollut kokemusta tämäntyyppisistä tilauksista. Teknisiä ongelmia ei tunnistettu suunnittelun ja rakentamisen aikana.
Suomenlinna II:n aloitteleville päälliköille annettiin raportin mukaan liian vähän koulutusta. Varsinkin erikoistilanneharjoittelua olisi pitänyt olla enemmän. Myös viranomaisvalvonnassa oli puutteita. Esimerkiksi sähköasennuksia tekevien riittävä ammattitaito olisi selvityksen mukaan pitänyt varmistaa.