Konservatiivijohtajaan Edmund Stoiberiin kohdistunut arvostelu on leimahtanut avoimeksi syrjäytyskamppailuksi Baijerissa Etelä-Saksassa. Osavaltion konservatiivipuolue CSU odottaa 65-vuotiaalta johtajaltaan selväsanaista vetäytymistä vuoden 2008 puheenjohtajakisasta ja siten väistymistä myös Saksan merkittävimpiin kuuluvan osavaltion pääministerin paikalta.
Mielipidekyselyissä lähes kaksi kolmasosaa baijerilaisista on ilmaissut toivovansa Stoiberin luopuvan osavaltion johdosta. Neljä viidestä katsoo pääministeri-puoluejohtajan roikkuvan enää epätoivon vimmalla kiinni vallassa.
Stoiber itse on kaavaillut hallitsevansa Baijeria vielä yhden kauden 2008-2013.
Vauhtia Stoiberiin kohdistuvaan myllytykseen ovat antaneet etenkin Baijerin vahvan miehen poliittinen sooloilu ja häntä vastaan viime viikkoina nostetut syytökset. Näiden mukaan Stoiber on muun muassa antanut läheisen työntekijänsä urkkia puoluetoverinsa Gabriele Paulin yksityiselämää Stasi-tyyliin.
Stoiberin lähtölaskenta käynnistyi jo vuonna 2005, kun baijerilaisen kikkailu rasitti vakavasti CSU:n ja sen suuremman kristillisdemokraattisen sisarpuolueen CDU:n välejä. Stoiber hylkäsi tuolloin yllätten ministerisalkun kansleri Angela Merkelin suuressa koalitiohallituksessa ja pelasti itsensä poliittiseen paitsioon Saksan konservatiivien keskuudessa.
Lisää vettä hän kaatoi arvostelijoiden myllyyn ripittäytymällä saksalaispaavi Benedictus XVI:lle. Pyhälle isälle baijerilaispatriarkka kertoi kahden kesken, ettei kykene istumaan samassa hallituksessa kristillisdemokraattista sisarpuoluetta CDU:ta edustavan naiskansleri Merkelin kanssa.
CDU ja CSU muodostavat Saksan nykyisen suuren koalitiohallituksen yhdessä sosiaalidemokraattisen SPD:n kanssa.
Myös kotona Baijerissa Stoiberin äkillinen vetäytyminen liittotasvallan hallituksesta herätti pahaa verta. Puoluejohtaja-pääministerin poliittinen pesänjako oli ehditty käynnistää jo Stoiberin lyhyen Berliinin-seikkailun aikana, joten hänen paluunsa pani pakan uusiksi. Se ärsytti etenkin CSU-kruununprinssien Baijerin sisäministerin Günther Becksteinin ja kansliapäällikkö Erwin Huberin tukijoita.
Vuoden 2005 vaalien yhteydessä Stoiber hankki itselleen ja puolueelleen kielteistä julkisuutta myös haukkumalla itäsaksalaiset tyhmiksi vasikoiksi.
14 vuotta Baijeria hallinnut Edmund Stoiber on yksi Saksan pitkäaikaisimmista ja menestyksekkäimmistä osavaltiopääministereistä. Valtakunnanpolitiikassa jäykkänä ja huumorittomana pidetty Stoiber ei tosin ole onnistunut tekemään läpimurtoa.
Merkittävimmän tappionsa Edmund Stoiber koki vuonna 2002. Saksan kristillisdemokraatit hävisivät tuolloin Stoiber kansleriehdokkaanaan maan liittopäivävaalit niukasti Gerhard Schröderin sosiaalidemokraateille.
Vaalit romuttivat Stoiberin kanslerihaaveet ja ratkaisivat epäsuorasti Angela Merkelin nousun Saksan kristillisdemokraattien johtoon.
Stoiberin kaudella mahtipuolueen CSU:n kannatus on romahtanut alle 50 prosentin. .