Kroatian haluttomuus yhteistyöhön Jugoslavian sotarikoksia tutkivan Haagin tuomioistuimen (ICTY:n) kanssa on yksi suurimmista kompastuskivistä Kroatian EU-tiellä.
Kroatia jätti jäsenyyshakemuksensa helmikuussa, ja EU:n komissio ottaa kantaa siihen ensi keväänä. Taloudellisesti Kroatiaa pidetään ainakin yhtä kehittyneenä kuin Romaniaa ja Bulgariaa, jotka toivovat pääsevänsä EU:hun vuonna 2007.
Kroatia ei ole suostunut luovuttamaan mm. kenraali Ante Gotovinaa Haagiin tuomioistuimen toistuvista pyynnöistä huolimatta.
Kroatia ei ole kyennyt järjestämään myöskään serbipakolaisten paluumuuttoa ja heidän omaisuutensa palauttamista EU:n haluamalla tavalla.
Suuria puutteita on myös Kroatian oikeuslaitoksessa. Tuomioistuimia pidetään puolueellisina ja tuomareita helposti lahjottavina.