Osa sairaanhoitopiireistä ja terveyskeskuksista kritisoi sikainfluenssan viranomaisohjausta. Kritiikki kohdistuu lähinnä lääkehoitoa ja rokotuksia koskevaan ohjaukseen sikainfluenssaepidemian aikana.
Sosiaali- ja terveysministeriön kyselyyn vastanneista sairaanhoitopiireistä yli puolet olisi kaivannut selkeämpiä lääkkeiden käyttöä koskevia määräyksiä. Osa sairaanhoitopiireistä ja terveyskeskuksista koki, että lääkkeiden käyttöä sikainfluenssaepidemian hoidossa rajoitettiin liikaa.
Valtaosa vastaajista on kuitenkin sitä mieltä, että viranomaisohjaus toimi hyvin sikainfluenssa-aallon jarruttamisessa ja myöhemmin sen lieventämisessä.
Kyselyyn vastasi 20 sairaanhoitopiiristä 16. Vajaasta 200 Suomen terveyskeskuksesta ministeriölle vastasi hieman yli sata.
