Suomenlahdella ja Saaristomerellä toimivien yhteysalusten liikennöintiä tuetaan eri periaatteiden mukaisesti. Tukien erilaisuus ärsyttää Suomenlahden saariston asukkaita, jotka vaativat lisämäärärahaa alueensa yhteysalusliikenteeseen.
Saaristomerellä yhteysalusliikennettä hoitaa Merenkulkulaitos. Suomenlahden liikennettä hoidetaan ostopalveluna.
Suomenlahden saaristokuntien mukaan nykyinen alueen yhteysalusille osoitettu tuki ei ole riittävä, jotta sillä voitaisiin taata asukkaiden kulkumahdollisuudet mantereelle.
Saaristomeren saarilla asuu ympäri vuoden 990 ihmistä ja Suomenlahdella on asukkaita 220. Saaristomeren liikenne- ja kuljetuspalveluita tuetaan vuosittain 7,7 miljoonalla eurolla, kun vastaava tuki Suomenlahden alueelle on 286 000 euroa.