Ratatyöt vaikuttavat junien kulkuun kesän ja syksyn aikana. Muutoksia on sekä kauko- että lähijunien kulkuun. Koronatilanteesta johtuen kesän aikataulut julkaistaan toukokuun loppuun mennessä, ja junaliput tulevat myyntiin samassa yhteydessä.
Kesän lähestyessä myös Väyläviraston teettämien ratatöiden määrä perinteisesti lisääntyy, mikä vaikuttaa jonkin verran myös junien kulkuun. Toukokuussa Helsingin ratapihan toimivuutta parantavan hankkeen puitteissa tehdään ratatöitä Pasilassa 17. toukokuuta.
Pasilassa junien lähtöraiteissa on muutoksia. Toukokuussa ratatöistä aiheutuvia muutoksia on myös Pohjanmaalla 16.–17. toukokuuta, jolloin kaikki päiväjunat Kokkola–Oulu- ja Iisalmi–Ylivieska -reiteillä korvataan busseilla.
Väylävirasto uusii turvalaitteet pääradalla Tampereen ja Seinäjoen välillä, mikä vaikuttaa merkittävästi junaliikenteeseen toukokuun neljännen ja joulukuun 12. päivän välisenä aikana. Kaukoliikenteessä junien matka-aika hidastuu keskimäärin 10 minuutilla Tampereen ja Seinäjoen välillä.
Lisäksi muutamia illan viimeisiä junia korvataan busseilla aina maanantaista torstaihin sekä sunnuntaisin. Parittomilla viikoilla bussikorvauksia on myös perjantaisin ja lauantaisin. Tarkemmat tiedot bussivuoroista löytyvät VR:n sivuilta.
Korvaavien bussien hitaampi matka-aika vaikuttaa myös vaihtoyhteyksiin. Muutoksilla on vaikutuksia myös yöjunaliikenteeseen, eikä esimerkiksi Turun ja Rovaniemen välillä kulje ratatyön aikana suoria yöjunia. Vaikutukset yöjunaliikenteeseen tarkentuvat myöhemmin, sillä tällä hetkellä yöjunaliikenne on koronatilanteen vuoksi toistaiseksi keskeytetty.
