Rakentaminen sekä maa- ja metsätalous pilaavat lampia, puroja ja lähteitä. Ympäristön muutoksille alttiiden pienvesien hoitoon on kuitenkin viime vuosina herätty.
Suomen luonnonsuojeluliitto antaa tunnustusta kuntien, ympäristökeskusten, Metsähallituksen ja järjestöjen lukuisille hankkeille, jolla on kartoitettu pienvesien kuntoa ja ryhdytty elvyttämään luontoa.
Puroilla, noroilla, lähteillä ja lammilla suuri merkitys eläinten elinympäristöinä ja kulkureitteinä, ja niissä on oma erityislaatuinen kasvi- ja eläinlajistonsa.
Pienvedet ylläpitävät luonnon monimuotoisuutta. Koska niissä on vähän vettä, ne ovat hyvin alttiita veden laadun muutoksille.
Pienvesille ei ole omaa suojeluohjelmaa, mutta niitä kuuluu erilaisiin suojelualueisiin ja kansallispuistoihin. Parhaiten ovatkin säilyneet luonnonsuojelualueiden ja Pohjois-Suomen pienvedet.