Puutiaisaivotulehdus voi aiheuttaa lapsille pitkäaikaisia neurologisia vaurioita. Lasten puutiaisaivotulehdusta on pidetty aiemmin aikuisten versiota lievempänä.
Uudessa ruotsalaistutkimuksessa havaittiin, että lapsilla oli huomattavasti useammin väsymystä ja toistuvaa päänsärkyä kuin kontrolliryhmään kuuluvilla.
Puutiaisaivotulehdus on punkin puremasta aiheutuva virusinfektio.