Päästökauppa pakottaa ottamaan uudelleen kantaa kotimaisen turpeen asemaan lämmön ja sähkön lähteenä. Turpeen kilpailukyky joutuu ilman tukitoimia koetukselle, koska päästökauppa suosii turvetta vähäpäästöisempiä polttoaineita.
Turveala huomauttaa, että ääritapauksessa hiili voi päästökaupan seurauksena lähes syrjäyttää turpeen, joka on puun jälkeen merkittävin kotimainen biopolttoaine. Päästökauppaa valmistelevan kauppa- ja teollisuusministeriön mukaan tällainen mahdollisuus on kuitenkin häviävän pieni.
Turpeen ja muiden polttoaineiden kohtelu vuonna 2005 alkavaksi suunnitellussa päästökaupassa ja siihen sovitettavassa energiaverotuksessa on vielä auki. Päästökaupan, energiaverotuksen ja energiantuotannon tukien yhteensovittamista valmistellaan kauppa- ja teollisuusministeriön työryhmässä ensi vuoden huhtikuun loppuun saakka.