Oulun Satamalle on myönnetty laatu- ja ympäristösertifikaatit. Ne on myöntänyt ulkopuolinen auditoija SFS Sertifiointi Oy. Laatukäsittely koskee sataman kokonaisuuden kehittämisen ja ylläpitämisen sekä alusten, nostureiden, jäänmurtajien ja hinausten palvelut.
Oulun Satama pyrkii kehittämään laatu- ja ympäristöjärjestelmästään laajan ja tehokkaan johtamisen osaksi. Oulun Satama on myös mukana kehittämässä yhteistyökumppaneiden kanssa kuljetusketjua, jossa muun muassa otetaan huomioon ympäristöasiat.