Pyöräilyhistorian suurin poliisitutkinta Operaatio Puerto johtaa sittenkin oikeuskäsittelyyn. Madridilainen oikeusistuin on kumonnut aiemman päätöksen, jonka mukaan jutun tutkinta jo lopetettiin kertaalleen ja määrännyt, että epäillyt on asetettava syytteeseen.
Viikonvaihteessa julkaistussa päätöksessä oikeus määräsi, että dopingrinkiä pyörittänyt espanjalainen lääkäri Eufimiano Fuentes joutuu vastaamaan syytteisiin oikeudessa.
Avoinna on yhä, ketkä muut dopingin käyttöön osallistuneet joutuvat syytteeseen. Varmaa on kuitenkin, etteivät dopingia käyttäneet urheilijat joudu syytteeseen.
Aiemmin annetun tutkinnan lopettamispäätöksen taustalla oli oikeuden kanta, ettei Fuentes ollut toimillaan aiheuttanut dopingia käyttäneille urheilijoille terveydellistä haittaa.
Operaatio Puertona tunnetussa tutkinnassa Fuentesin laboratoriosta löydettiin toukokuussa 2006 noin sata verinäytettä. Yli 50 pyöräilijää joutui dopingepäilyjen kohteeksi, heidän joukossaan vuoden 1997 Ranskan ympäriajon voittaja Jan Ullrich ja Italian ympäriajon voittaja Ivan Basso.