Meksikonlahden öljyvuodon vaikutukset ekosysteemiin ovat arvaamattomia. Myrkyt leviävät jo ravintoketjussa, joka voi tuoda katastrofin jälkiä myös ihmisiin.
Vaarassa on noin 400 lajia äyriäisistä merikilpikonniin, pelikaaneihin ja kaskelotteihin - ja syksyllä Meksikonlahdelle muuttaa vielä miljoonia lintuja lisää. Öljyä ja muita jäämiä päätyy myös erilaisiin pieneliöihin, joista osa uhkaa hävitä alueelta kokonaan.
Joidenkin eliöiden kannoissa on havaittu äkillistä vähenemistä, mikä vaikeuttaa taas monien muiden lajien selviämistä. Muun muassa merikilpikonnia on kuollut sadoittain.
Viranomaiset ovat löytäneet yli 2 600 kuollutta lintua, nisäkästä ja kilpikonnaa, mutta tuhojen todellista laajuutta ei tiedä kukaan. Menehtyneiden haiden ja muiden kalojen määriä ei saada ehkä koskaan selville.