Metsähallituksen luontopalvelut löysi viime kesän lajikartoituksissa Mallan luonnonpuistosta kuusi erityisesti suojeltavaa lajia. Harvinaisimpia näistä ovat kolusammal ja lapinpahtasammal.
Lapinpahtasammalella on Suomessa ainoastaan kolme esiintymää, joista kaksi Mallalla. Kolusammalella on kahdeksan tunnettua esiintymää Suomessa.
Mallalle täysin uusina erityisesti suojeltavina lajeina löydettiin vaarantuneet pohjankellosammal ja lettokehräsammal. Erittäin uhanalaisen rusopahtasammalen esiintymistä suurin osa on Mallalla. Muita uhanalaisia lajeja ovat isokarvasammal, naalin- ja poronsuikerosammal, tunturilehväsammal ja karvakäppyräsammal.
Luonnonpuiston sammallajistoa ei ollut aikaisemmin kartoitettu kattavasti. Uhanalaisten, silmälläpidettävien ja alueellisesti uhanalaisten lajien yhteenlaskettu havaintomäärä yli kaksinkertaistui aiemmin tiedossa olleeseen verrattuna.
Mallan luonnonpuisto, etenkin Pikku-Malla, on koko Suomen mittakaavassa ainutlaatuinen uhanalaisten sammalten keskittymä. Mallan alueesta erityisen sammalten kannalta tekee voimakas kalkkivaikutus, joka toisinaan yhdistyy myös valuvetisyyteen pahdoilla.