Etelä- ja Pohjois-Savon luonnonsuojelupiirit vastustavat Savon kanavan rakentamista. Luonnonsuojelupiirien mielestä hankesuunnitelma on keskeneräinen ja epärealistinen.
Järjestöjen mielestä julkisia varoja ei pidä käyttää luontoa ja ympäristöä peruuttamattomasti muuttavaan vesirakentamiseen pelkästään huviveneilyn toteutumiseksi Saimaalta Päijänteelle.
Pieksämäen seudun luonnonystävien puheenjohtajan Jaakko Savolan mielestä Savon maakunnissa asuvien etu olisi saada käytössä olevat varat mieluummin matkustaja- ja tavaraliikennettä palvelevan raideliikenteen kehittämiseen.
Vihreän liiton puheenjohtaja Osmo Soininvaara on aiemmin suositellut kanavarahojen käyttämistä Savon radan parantamiseen.
Kanavahanke on hyväksytty Pohjois-Savon liiton maakuntavaltuustossa, mutta hankkeen toteutuminen riippuu pitkälti valtion rahoituspäätöksistä.
Suunniteltu uusi vesireitti yhdistäisi Saimaan ja Päijänteen vesireitit.