Liikkuvat mastot ja sukellukset ovat suurimmat uhat Vrouw Maria -hylyn säilymiselle. Hylyssä on kaksi pystyssä seisovaa mastoa, joista etummainen nojaa keulapuomiin.
Kaatuessaan mastot repisivät hylyn kansirakenteita ja rikkoisivat vuosisatoja vallinneen tasapainotilan ruumassa. Mastojen liikettä seurataan taaimmaiseen mastoon kiinnitetyllä mittalaitteella. Tietoa liikkeestä saadaan talven jälkeen.