Sisäministeriö on jakanut yhdistyville kunnille hankerahaa tietämättä tarpeeksi suunniteltujen hankkeiden sisällöstä. Kaikkia hankkeita ei ole toteutettu koskaan. Tämä kävi ilmi Valtiontalouden tarkastusviraston (VTV) tutkimuksessa, jossa käytiin läpi kuntaliitoksia vuosilta 2003-2005.
Tarkastusvirasto kehottaa sisäministeriötä tarkkailemaan rahojen käyttöä jatkossa tarkemmin. Sen mukaan valvontaa ei ole tähän asti käytännössä ollut. Jatkossa puolet hankerahoista onkin tarkoitus antaa kunnalle vasta, kun hanke on saatu päätökseen.
Kunnille maksettavien yhdistymistukien määrä on kasvanut varsinkin vuodesta 2002 lähtien. Noin neljäsosa tuesta maksetaan erilaisia hankkeita varten. VTV varoittaa, etteivät valtion rahat jatkossa riitä vastaaviin porkkanoihin, jos kuntien yhdistymistahti kiihtyy odotetusti.