Kirkkovaltuusto on yksittäisen seurakunnan ylin päättävä elin. Sen jäsenet valitaan seurakuntavaaleissa neljän vuoden välein. Kirkkovaltuusto tekee seurakunnan taloutta ja viranhaltijoita koskevat tärkeimmät päätökset.
Joissakin seurakunnissa valittiin jälleen myös seurakuntaneuvostoja. Pohjois-Suomessa näin on Oulussa, jossa seurakunnallisessa yhtymässä on neljä erillistä jäsenseurakuntaa.
Seurakuntaneuvosto on hallintoa hoitava toimielin. Seurakuntaneuvoston jäsenet ovat luottamushenkilöitä. Puheenjohtajana on kirkkoherra. Seurakuntaneuvosto johtaa osaltaan seurakunnan toimintaa ja edistää sen hengellistä elämää. Se päättää niiden varojen käytöstä, jotka seurakunnalle osoitetaan yhtymän talousarviossa.
Seurakuntaliitosten jälkeen Pohjois-Suomessakin on nykyään useita kappeliseurakuntia ja niissä kappelineuvostoja. Niiden jäsenet valitsee kirkkovaltuusto. Samoin kirkkovaltuusto valitsee jäsenet seurakuntien kirkkoneuvostoihin. Ne ovat seurakunnan hengellistä työtä ja muuta toimintaa johtavia elimiä.
