Äkillistä keuhkoputkentulehdusta hoidetaan edelleen liian usein antibiooteilla. Kolmelle neljäsosalle potilaista kirjoitetaan mikrobilääkeresepti, vaikka Käypä hoito -suosituksen mukaan niitä tarvittaisiin huomattavasti harvemmin.
Vain noin 20 prosentissa tapauksista tulehduksen aiheuttaa bakteeri. Yleisimmin taudin aiheuttajana on virus, johon antibiootit eivät tehoa.
Mikrobilääkkeiden käyttöä seuraavan Mikstra-työryhmän selvityksen mukaan mikrobilääkkeiden käyttö on jopa lisääntynyt Käypä hoito -suosituksen julkaisemisen jälkeen.
Ennen suosituksen julkaisemista noin 66 prosenttia potilaista sai antibioottireseptin. Suosituksen antamisen jälkeen reseptin saaneiden potilaiden osuus kasvoi 75 prosenttiin. Lääkärit määräävät kuitenkin aiempaa lyhyempiä lääkekuureja.
Terveyskeskuslääkäreillä ei ole aina etenkään päivystyksessä luotettavia keinoja selvittää, johtuuko infektio bakteereista vai viruksista. Käytännön vastaanottotilanteessa on myös vaikeaa erottaa keuhkoputkentulehdus keuhkokuumeesta. Silloin usein määrätään antibioottikuuri varmuuden vuoksi.