Suomen kansallisoopperaa johtaa toistaiseksi johtoryhmä kollegiaalisesti.
Johtoryhmään kuuluvat hallintojohtaja Pekka Kauranen, ylikapellimestari Mikko Franck, pian tehtävänsä jättävä baletinjohtaja Dinna Björn, tekninen johtaja Timo Tuovila ja tuotantojohtaja Keijo Kupiainen. Johtoryhmän puheenjohtajana toimii hallintojohtaja Pekka Kauranen.
Johtoryhmän lisäksi Kansallisoopperassa aloittaa taiteellinen toimikunta, jonka vastuulla on taiteellinen suunnittelu.
Taiteelliseen toimikuntaan kuuluvat Franck, Björn ja taiteellinen suunnittelupäällikkö Tuulikki Närhinsalo. Taiteellinen toimikunta raportoi johtoryhmälle.