Euroopan komissio on hyväksynyt viimeisetkin Interreg III-ohjelmat, joissa Suomi on mukana. Kaudella 2000–2006 toteutettavia Interreg-ohjelmia on siten kaikkiaan yhdeksän.
Niiden EU-rahoituksen arvo on yhteensä noin 290,6 miljoonaa euroa. Tämän lisäksi ohjelmien toteuttaminen nielee lähes saman verran kansallista julkista rahoitusta.
Interreg III:lla tuetaan valtioiden rajat ylittävää sekä valtioiden ja alueiden välistä yhteistyötä.
Sisäministeriön mukaan Interreg-rahoituksen kysyntä on ollut Suomessa ohjelmien käynnistysvaiheessa kova. Suomen osalta erityinen haaste on rajan ylittävä yhteistyö Venäjän ja Viron suuntaan.
Näitä ohjelmia ovat muun muassa Karjalan ohjelma, jolla tuetaan raja-alueyhteistyötä Karjalan tasavallan kanssa ja Kaakkois-Suomen ohjelma, jossa yhteistyökumppaneina ovat Pietarin kaupunki ja Leningradin alue.
Etelä-Suomen rannikkoseudun ohjelmalla edistetään yhteistyötä Viron kanssa. Näiden ohjelmien ensimmäiset hankkeet valittiin joulukuussa.