Punkaharjun vanhan kaatopaikan puhdistuksen arvioidaan maksavan vähintään 1,5 miljoonaa euroa. Juuri valmistuneen ympäristöselvityksen mukaan haitta-aineita löytyy alueen pinta- ja pohjavesistä. Etelä-Savon ympäristökeskuksen mukaan kyse ei ole kuitenkaan sellaisista ympäristö- tai terveysriskeistä, jotka vaatisivat välittömiä toimia.
Punkasalmen kaatopaikka poistettiin käytöstä 1991. Alueelle on haudattu muun muassa vaneritehtaan jätetynnyreitä, jotka sisältävät liima- ja torjunta-aineita. Alueen pinta- ja pohjavesissä havaitut haitta-ainepitoisuudet ovat kuitenkin pieniä. Vesien virtaussuunta on länteen kohti Puruveden Salkolahtea.
Alueen puhdistamisessa on kaksi päävaihtoehtoa, joista toisessa kaatopaikan jätetäyttö poistettaisiin kokonaan ja alue maisemoitaisiin. Toisessa vaihtoehdossa kaatopaikalle rakennettaisiin uudet pintaeristysrakenteet ja jätetäytöstä suotautuvat vedet johdettaisiin jätevesiviemäriin. Tällöin alueelle jäisi maankäyttörajoitus. Molempien vaihtoehtojen työkustannukset ovat noin 1,5 miljoonaa euroa.
Puhdistamisesta päätetään aikanaan erikseen. Ympäristökeskuksen mukaan työt voisivat alkaa aikaisintaan 2011.