Joensuun seudun rata-alueilla on vaikeasti korjattavia meluongelmia. Erityisesti Joensuun ratapihan ympäristössä meluntorjunta on hankalaa, koska rata ja asutus ovat lähellä toisiaan. Myös tärinä aiheuttaa häiriöitä radan lähialueen asukkaille. Melua voidaan kuitenkin vähentää eräillä alueilla meluesteillä.
Raideliikenteen tärinästä aiheutuvia ongelmia voidaan lieventää alentamalla tavarajunien nopeuksia ongelmapaikoissa. Melun ja tärinän lisäksi rata-alueilla on kiinnitettävä huomiota pohjavesien suojeluun ja maaperän pilaantumiseen.
Junaliikenteen aiheuttamia melu- ja tärinäongelmia selvitettiin Ratahallintokeskuksen ja Joensuun seudun kuntien yhteisessä ympäristöselvityksessä, jonka tuloksia esiteltiin maanantaina Joensuussa.