Juhannuksen juhliminen vesillä saattaa häiritä lintujen pesintää.
Birdlife -järjestö pyytää välttämään liikkumista lintujen pesimäsaarilla ja -luodoilla. Luodoilla pesivillä lokeilla, tiiroilla ja kahlaajilla on juhannuksen aikaan paljon munia ja pieniä poikasia. Esimerkiksi kokon polttaminen pesimäluodolla voi järjestön mukaan tuhota linnuston täysin.
Linnut pesivät tavallisesti pienillä ja lähes puuttomilla luodoilla. Selvä merkki pesinnästä ovat lähellä ihmisiä lentelevät tai hyökkäilevät linnut. Monien vesilintujen pesintä jatkuu heinäkuun lopulle asti.