Kuntien täytyy nykyisin laatia erillinen elintarvikevalvontasuunnitelma, jossa päätetään tarkastettavat kohteet. Myymälöistä tarkastuskohteiksi valikoidaan lähinnä sellaisia kauppoja, joissa käsitellään helposti pilaantuvia, pakkaamattomia elintarvikkeita kuten lihaa ja kalaa.
Tarkastuksissa kiinnitetään huomiota muun muassa hygieniaan, elintarvikkeiden säilytyslämpötiloihin, yleiseen siisteyteen ja omavalvonnan tehokkuuteen.
Usein tarkastukset johtavat huomautuksiin, jotka poikivat lisätarkastuksia. Jos yritys ei lukuisista kehotuksista huolimatta ole korjannut huomattuja epäkohtia, voidaan ne määrätä korjattaviksi uhkasakon voimalla. Äärimmäisessä tapauksessa liike voidaan määrätä väliaikaisesti suljettavaksi.
Vuonna 2007 kuntien tekemissä elintarvikevalvontaan liittyvissä tarkastuksissa joka viidennessä kohteessa ryhdyttiin toimenpiteisiin. Yleisimmät syyt olivat puutteet omavalvonnassa ja yleisessä hygieniassa.