Oikeudenkäynti indonesialaista uskonoppinutta Abu Bakar Bashiria vastaan on edennyt rangaistusvaatimusten esittämiseen. Syyttäjät vaativat 15 vuoden vankeustuomiota Jemaah Islamiah -verkoston johtajana pidetylle Bashirille.
Bashiria syytetään vallankaappausyrityksestä ja kirkkoja vastaan tehtyjen pommi-iskujen hyväksymisestä. Kirkkojen pommittamisen uskotaan myös olleen yhteydessä silloisen varapresidentin Megawati Sukarnoputrin epäonnistuneeseen murhayritykseen.
Ennen oikeudenistuntoa Bashir syytti radiohaastattelussa Yhdysvaltain keskustiedustelupalvelua CIA:ta Balin ja Jakartan pommi-iskuista. Hänen mukaansa Balin iskua ei tutkittu perinpohjaisesti, koska iskun halutaan tahrivan islamin nimeä.
Useat todistajat ovat nimenneet Bashirin Jemaah Islamiah -verkoston hengelliseksi johtajaksi. Jemaah Islamiahilla uskotaan yleisesti olevan yhteyksiä al Qaida -verkostoon.