Valtion budjetin ohi Suomeen virtasi EU:n rahaa arviolta 400–500 miljoonaa markkaa vuonna 1999. Valtiontalouden tarkastusvirastossa on valmistunut ensimmäinen selvitys rahavirroista. Arvio perustuu valtiovarainministeriön ja Tilastokeskuksen keräämiin tietoihin.
Rahoista arviolta noin puolet menee kuntiin, vajaa puolet yrityksille ja kymmenesosa yleishyödyllisille yhteisöille.
Tarkkaa lukua näistä rahoista on vaikea pitää, toteaa erityistutkija Leena Juvonen tarkastusvirastosta. Esimerkiksi kunnat ovat itse saaneet arvioida paljonko ne ovat saaneet EU-tukia budjetin ohi.
EU maksaa Suomeen valtion budjetin kautta muun muassa maatalous- ja rakennetukia, joita valtio sitten jakaa eteenpäin. Budjetin ohi menevät esimerkiksi tutkimusohjelmien määrärahat, joita maksetaan suoraan ohjelmien toteuttajille. Valtion tileissä nämä rahat eivät näy.