Aurajoen kunnostus pohjapatojen avulla etenee Varsinais-Suomessa. Ensisijaisesti kyse on Itämeren suojelemisesta, sillä padot estävät ravinteiden ja lietteen valumista mereen. Pohjapadot lisäävät myös veden viipymää joessa, luovat kosteikkoja ja suovat mahdollisuuden nostaa pelloista huuhtoutunutta maata takaisin pelloille.
Patoja on rakennettu vasta yksi, mutta tänä vuonna niitä perustetaan muutama lisää. Lisää padoille sopivia paikkoja löytyy jatkuvasti.
Pohjapato hidastaa veden virtausta ja nostaa joen pintaa joillakin kymmenillä sentillä. Hitaammin virtaavassa vedessä sedimentti vajoaa helpommin pohjaan ja typpeä sitoutuu enemmän ilmaan. Veden noususta syntyvät kosteikot sitovat myös ravinteita.
Pohjapatohanke saa rahoitusta esimerkiksi EU:n tavoite 2 -ohjelmasta ja Varsinais-Suomen liitolta.